Dostęp do apletu bezpiecznego usuwania sprzętu możesz uzyskać choćby poprzez komendę rundll32.exe shell32.dll,Control_RunDLL hotplug.dll
A odnośnie tego, czemu ikona znikła, to zajrzyj do klucza HKEY_LOCAL_MACHINE -> SOFTWARE -> Microsoft -> Windows -> CurrentVersion -> Explorer -> HotPlugNotification i sprawdź, czy w wartosci domyślnej masz wpis %windir%\system32\hotplug.dll,HotPlugSafeRemovalDriveNotification