Jest trochę w sieci porównań PCIE 3.0 vs PCIE2.0 - tutaj przykładowe http://www.overclock.net/t/1188376/hardwarecanucks-hd-7970-pci-e-3-0-vs-pci-e-2-0-comparison
Wychodzi na to, że różnice są do pominięcia (przynajmniej na dzień dzisiejszy).
Ale jak kupujesz nową kartę i masz już Ivy Bridge to wybierz taką z PCIE 3.0