Przerabiałem podobny układ na płycie Gigabyte, na części raid0 wszystko funkcjonowało prawidłowo a na częsci raid1 były problemy z dostępem do plików (np odtwarzanie muzyki z tej partycji w winampie wieszało system) a IMSM pokazywał błąd macierzy. Ostatnio wszystko ustawiłem na jeden wolumin raid0 i od tej pory żadnych problemów.
Albo to wina Gigabyte albo sterownikow/kontrolera Intela.